Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH5P33151 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH5P33151 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH5P33151 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH5P33151 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH5P33151 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH5P33151 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH5P33151 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH5P33151 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH5P33151 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH5P33151 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms