Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBSP08397 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBSP08397 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBSP08397 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBSP08397 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBSP08397 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBSP08397 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBSP08397 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBSP08397 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBSP08397 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBSP08397 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms