Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFLP07196 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFLP07196 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFLP07196 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFLP07196 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFLP07196 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFLP07196 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFLP07196 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFLP07196 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFLP07196 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFLP07196 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms