Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA12Q9UI09 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA12Q9UI09 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA12Q9UI09 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA12Q9UI09 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFA12Q9UI09 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFA12Q9UI09 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms