Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASS4Q9NQ75 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms