Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms