Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BEST4Q8NFU0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BEST4Q8NFU0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms