Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms