Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS1P54277 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS1P54277 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS1P54277 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS1P54277 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS1P54277 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS1P54277 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS1P54277 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS1P54277 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS1P54277 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS1P54277 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS1P54277 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS1P54277 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS1P54277 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS1P54277 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS1P54277 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS1P54277 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS1P54277 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms