Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA4P43358 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA4P43358 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms