Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RXRAP19793 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRAP19793 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRAP19793 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRAP19793 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRAP19793 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RXRAP19793 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RXRAP19793 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RXRAP19793 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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