Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL2O95198 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms