Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms