Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB5Q9Y5E4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB5Q9Y5E4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB5Q9Y5E4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB5Q9Y5E4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB5Q9Y5E4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB5Q9Y5E4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB5Q9Y5E4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms