Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5Z1

DHX35, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX35Q9H5Z1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX35Q9H5Z1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX35Q9H5Z1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms