Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM106CQ9BVX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM106CQ9BVX2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms