RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560912.5

CRNDE-210, Transcript of colorectal neoplasia differentially expressed, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CRNDE, Length 459 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNDE-210ENST00000560912 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.47■■■■■ 5.35
CRNDE-210ENST00000560912 ABCC9O60706 1549 aa43.77■■■■■ 4.6
CRNDE-210ENST00000560912 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.74■■■■■ 4.59
CRNDE-210ENST00000560912 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.64■■■■■ 4.26
CRNDE-210ENST00000560912 NACADO15069 1562 aa41.3■■■■■ 4.2
CRNDE-210ENST00000560912 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.2■■■■■ 4.19
CRNDE-210ENST00000560912 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.86■■■■■ 4.13
CRNDE-210ENST00000560912 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.7■■■■■ 4.11
CRNDE-210ENST00000560912 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.69■■■■■ 4.1
CRNDE-210ENST00000560912 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.09
CRNDE-210ENST00000560912 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.49■■■■■ 4.07
CRNDE-210ENST00000560912 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
CRNDE-210ENST00000560912 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.08■■■■■ 4.01
CRNDE-210ENST00000560912 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.94■■■■□ 3.98
CRNDE-210ENST00000560912 SCRIBQ14160 1630 aa39.72■■■■□ 3.95
CRNDE-210ENST00000560912 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.62■■■■□ 3.93
CRNDE-210ENST00000560912 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
CRNDE-210ENST00000560912 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.46■■■■□ 3.91
CRNDE-210ENST00000560912 NCAPD3P42695 1498 aa38.09■■■■□ 3.69
CRNDE-210ENST00000560912 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.01■■■■□ 3.68
CRNDE-210ENST00000560912 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.94■■■■□ 3.66
CRNDE-210ENST00000560912 SMARCA4P51532 1647 aa37.91■■■■□ 3.66
CRNDE-210ENST00000560912 CUX2O14529 1486 aa37.89■■■■□ 3.66
CRNDE-210ENST00000560912 HMGXB3Q12766 1538 aa37.87■■■■□ 3.65
CRNDE-210ENST00000560912 SMARCA2P51531 1590 aa37.85■■■■□ 3.65
CRNDE-210ENST00000560912 ERCC6Q03468 1493 aa37.78■■■■□ 3.64
CRNDE-210ENST00000560912 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
CRNDE-210ENST00000560912 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.59■■■■□ 3.61
CRNDE-210ENST00000560912 NESP48681 1621 aa37.55■■■■□ 3.6
CRNDE-210ENST00000560912 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
CRNDE-210ENST00000560912 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
CRNDE-210ENST00000560912 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.33■■■■□ 3.57
CRNDE-210ENST00000560912 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.33■■■■□ 3.57
CRNDE-210ENST00000560912 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.19■■■■□ 3.54
CRNDE-210ENST00000560912 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.01■■■■□ 3.51
CRNDE-210ENST00000560912 WIZO95785 1651 aa36.91■■■■□ 3.5
CRNDE-210ENST00000560912 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.86■■■■□ 3.49
CRNDE-210ENST00000560912 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.76■■■■□ 3.48
CRNDE-210ENST00000560912 WDR62O43379 1518 aa36.75■■■■□ 3.47
CRNDE-210ENST00000560912 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.56■■■■□ 3.44
CRNDE-210ENST00000560912 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.49■■■■□ 3.43
CRNDE-210ENST00000560912 CFTRP13569 1480 aa36.45■■■■□ 3.43
CRNDE-210ENST00000560912 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CRNDE-210ENST00000560912 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CRNDE-210ENST00000560912 PRDM2Q13029 1718 aa36.28■■■■□ 3.4
CRNDE-210ENST00000560912 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CRNDE-210ENST00000560912 TRIM41Q8WV44 630 aa36.15■■■■□ 3.38
CRNDE-210ENST00000560912 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.94■■■■□ 3.34
CRNDE-210ENST00000560912 OSCARQ8IYS5 282 aa35.94■■■■□ 3.34
CRNDE-210ENST00000560912 IFT140Q96RY7 1462 aa35.83■■■■□ 3.33
CRNDE-210ENST00000560912 TOPBP1Q92547 1522 aa35.8■■■■□ 3.32
CRNDE-210ENST00000560912 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CRNDE-210ENST00000560912 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
CRNDE-210ENST00000560912 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
CRNDE-210ENST00000560912 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
CRNDE-210ENST00000560912 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CRNDE-210ENST00000560912 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.68■■■■□ 3.3
CRNDE-210ENST00000560912 ABCC8Q09428 1581 aa35.68■■■■□ 3.3
CRNDE-210ENST00000560912 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
CRNDE-210ENST00000560912 ARHGEF11O15085 1522 aa35.54■■■■□ 3.28
CRNDE-210ENST00000560912 CHD1O14646 1710 aa35.5■■■■□ 3.27
CRNDE-210ENST00000560912 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CRNDE-210ENST00000560912 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.252e-8■■■■□ 22.7
CRNDE-210ENST00000560912 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.22■■■■□ 3.23
CRNDE-210ENST00000560912 WDR97A6NE52 1622 aa35.22■■■■□ 3.23
CRNDE-210ENST00000560912 ARAP1Q96P48 1450 aa35.17■■■■□ 3.22
CRNDE-210ENST00000560912 SOGA1O94964 1423 aa35.15■■■■□ 3.22
CRNDE-210ENST00000560912 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.15■■■■□ 3.22
CRNDE-210ENST00000560912 CUX1P39880 1505 aa35.11■■■■□ 3.21
CRNDE-210ENST00000560912 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
CRNDE-210ENST00000560912 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.09■■■■□ 3.21
CRNDE-210ENST00000560912 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.08■■■■□ 3.21
CRNDE-210ENST00000560912 FBLN2P98095 1184 aa35.06■■■■□ 3.2
CRNDE-210ENST00000560912 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.06■■■■□ 3.2
CRNDE-210ENST00000560912 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
CRNDE-210ENST00000560912 SYNJ1O43426 1573 aa34.96■■■■□ 3.19
CRNDE-210ENST00000560912 GRIN2BQ13224 1484 aa34.94■■■■□ 3.18
CRNDE-210ENST00000560912 PBRM1Q86U86 1689 aa34.93■■■■□ 3.18
CRNDE-210ENST00000560912 SYNJ2O15056 1496 aa34.87■■■■□ 3.17
CRNDE-210ENST00000560912 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.81■■■■□ 3.16
CRNDE-210ENST00000560912 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CRNDE-210ENST00000560912 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.77■■■■□ 3.16
CRNDE-210ENST00000560912 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.76■■■■□ 3.16
CRNDE-210ENST00000560912 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
CRNDE-210ENST00000560912 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.56■■■■□ 3.12
CRNDE-210ENST00000560912 ADAMTS12P58397 1594 aa34.54■■■■□ 3.12
CRNDE-210ENST00000560912 GRIN2AQ12879 1464 aa34.52■■■■□ 3.12
CRNDE-210ENST00000560912 TOP2BQ02880 1626 aa34.51■■■■□ 3.11
CRNDE-210ENST00000560912 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.11
CRNDE-210ENST00000560912 CEP170Q5SW79 1584 aa34.45■■■■□ 3.11
CRNDE-210ENST00000560912 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.45■■■■□ 3.1
CRNDE-210ENST00000560912 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
CRNDE-210ENST00000560912 NUP160Q12769 1436 aa34.42■■■■□ 3.1
CRNDE-210ENST00000560912 SHROOM2Q13796 1616 aa34.39■■■■□ 3.1
CRNDE-210ENST00000560912 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.33■■■■□ 3.09
CRNDE-210ENST00000560912 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.32■■■■□ 3.08
CRNDE-210ENST00000560912 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.09■■■■□ 3.05
CRNDE-210ENST00000560912 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.09■■■■□ 3.05
CRNDE-210ENST00000560912 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CRNDE-210ENST00000560912 JPH4Q96JJ6 628 aa33.91■■■■□ 3.02
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