Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR53Q7Z5U6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms