Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms