Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN3Q16667 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDKN3Q16667 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDKN3Q16667 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDKN3Q16667 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDKN3Q16667 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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