Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms