Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24CP53992 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24CP53992 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms