Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP58Q9Y2X3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms