Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256 ms