Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3TC1Q8TE82 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3TC1Q8TE82 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms