Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR88Q6ZMY6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
WDR88Q6ZMY6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms