Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN3Q16667 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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