Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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