Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH5P33151 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH5P33151 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH5P33151 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH5P33151 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH5P33151 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms