Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF40AO75400 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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