Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRPC6Q9Y210 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms