Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPG2Q9UBF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms