Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL3Q8N8U3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms