Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms