Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.2 ms