Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4AQ13619 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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