Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 MRPL11YDL202W 750 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YDR133CYDR133C 336 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 UBC8YEL012W 657 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 CGR1YGL029W 363 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 GTT1YIR038C 705 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YJR037WYJR037W 384 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 EMC2YJR088C 879 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 AUR1YKL004W 1206 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 PCD1YLR151C 1023 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YAR070CYAR070C 300 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YLR290CYLR290C 834 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 INN1YNL152W 1230 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YPL035CYPL035C 348 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YPR077CYPR077C 372 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 MRP2YPR166C 348 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 PHO88YBR106W 567 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 RER1YCL001W 567 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 PWP2YCR057C 2772 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 RSF2YJR127C 4143 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YJR061WYJR061W 2808 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 ZDS2YML109W 2829 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 FRE4YNR060W 2160 nt3.63□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 CCM1YGR150C 2595 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 ASI1YMR119W 1875 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 MSM1YGR171C 1728 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 FOX2YKR009C 2703 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 CLB3YDL155W 1284 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 DOG1YHR044C 741 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 PPE1YHR075C 1203 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 EBS1YDR206W 2655 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 HUL5YGL141W 2733 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 ECM18YDR125C 1362 nt3.62□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 ARG2YJL071W 1725 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 BUD16YEL029C 939 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 MIG3YER028C 1185 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YHR173CYHR173C 339 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YIL024CYIL024C 570 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 PDR12YPL058C 4536 nt3.61□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 SKN7YHR206W 1869 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 SPT2YER161C 1002 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 MPC1YGL080W 393 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 SNX4YJL036W 1272 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 MRPL20YKR085C 588 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 GAB1YLR459W 1185 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 TIF34YMR146C 1044 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 ATG16YMR159C 453 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 DGA1YOR245C 1257 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 RRP7YCL031C 894 nt3.6□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 SPC105YGL093W 2754 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YDR535CYDR535C 501 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 RPS4BYHR203C 786 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 DUG3YNL191W 1074 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YOL118CYOL118C 309 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 FDH2YPL275W 711 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 YPR022CYPR022C 3402 nt3.59□□□□□ -1.83
CIK1Q01649 TFB2YPL122C 1542 nt3.59□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 KIN2YLR096W 3444 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 PIN4YBL051C 2007 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 TAF1YGR274C 3201 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 REB1YBR049C 2433 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 AIM7YDR063W 450 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 LIF1YGL090W 1266 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RPL1BYGL135W 654 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 PRP18YGR006W 756 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 PEX11YOL147C 711 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RPL1AYPL220W 654 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RTT109YLL002W 1311 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 GWT1YJL091C 1473 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 BMS1YPL217C 3552 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YHR202WYHR202W 1809 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 FAT1YBR041W 2010 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 URA2YJL130C 6645 nt3.58□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 SET1YHR119W 3243 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 SSM4YIL030C 3960 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 MGT1YDL200C 567 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ECO1YFR027W 846 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YGR064WYGR064W 369 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 PTI1YGR156W 1278 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 SLI1YGR212W 1407 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 FLO9YAL063C 3969 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RAD5YLR032W 3510 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RIF2YLR453C 1188 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 FIG1YBR040W 897 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 DSS4YPR017C 432 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YBR089WYBR089W 600 nt3.57□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ATP25YMR098C 1839 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ETP1YHL010C 1758 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YML096WYML096W 1578 nt3.56□□□□□ -1.84
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