Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00205P59089 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms