Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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