Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms