Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA4P22748 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA4P22748 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA4P22748 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA4P22748 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA4P22748 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA4P22748 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA4P22748 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA4P22748 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA4P22748 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA4P22748 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CA4P22748 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA4P22748 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA4P22748 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA4P22748 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA4P22748 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA4P22748 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms