Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTNP21246 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTNP21246 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTNP21246 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTNP21246 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTNP21246 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTNP21246 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms