Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms