Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD3Q9UJU5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms