Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG2Q9UBF2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG2Q9UBF2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms