Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms