Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE23Q8NDY6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms