Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms