Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
COL24A1Q17RW2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL24A1Q17RW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms