Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP5P51878 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP5P51878 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP5P51878 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP5P51878 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP5P51878 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP5P51878 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP5P51878 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP5P51878 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP5P51878 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms